ปุ๋ยอินทรีย์มี 4 ประเภท ได้แก่
1.ปุ๋ยคอก หมายถึง ปุ๋ยอินทรีย์ที่ได้จากสิ่งที่ขับถ่ายของสัตว์ และมูลสัตว์ต่างๆ เช่น โค กระบือ แกะ ม้า สุกร เป็ด ไก่ ค้างคาว ก่อนนำไปใช้จะต้องหมักไว้ให้เกิดการย่อยสลายก่อน โดดยทั่วไปจะมีปริมาณธาตุอาหารไนโตรเจน ฟอสฟอรัส และโพแทสเซียม อยู่
2.ปุ๋ยหมัก หมายถึง ปุ๋ยอินทรีย์ที่ได้จากการนำซากพืชและวัดุเหลือใช้ทางการเกษตรมาหมัก และผ่านกระบวนการย่อยสลายโดยกิจการรจุลินทรีย์ จนเปลี่ยนสภาพไปจากเดิมเป็นวัสดุที่มีลักษณะอ่อนนุ่ม เปื่ยยุ่ยไม่แข็งกระด้าง และมีสีน้ำตาลปนดำ
3.ปุ๋ยพืชสด หมายถึงปุ๋ยอินทรีย์ที่ได้จากการไถกลบพืชสดที่โตได้ขนาดที่เหมาะสมลงในดิน ธาตุอาหารในพืชสดจะถูกย่อยสลายและปลดปล่อยให้พืชหลังจากผ่านการย่อยสลายในดิน
4.น้ำหมักชีวภาพ ได้ขากการหมักชิ้นส่วนของพืชผัก ผลไม้ หรือสัตว์ชนิดต่างๆ กับกากน้ำตาล และน้ำ ผ่านกระบวนการย่อยสลายโดยจุลินทรีย์ ผลิตภัณฑ์ที่ได้ประกอบด้วยสารต่างๆ เช่น ธาตุอาหารพืช ฮอร์โมน กรดอมิโน กรดฮิวมิก กรดอินทรีย์เอ็นไซม์ วิตามิน มีผลต่อการส่งเสริมการเจริญเติบโตของพืช กระคุ้นการงอกของราก ช่วยให้พืชแข็งแรงต้านทานต่อโรคและแมลง ผลผลิตเพิ่มขึ้น สีสัน และรสชาติดีกว่าเดิม ช่วยยืดอายุการเก็บรักษาผลผลิต